部分集裝箱港口費用是航運公司向港口管理局繳納的服務費用，另一些港口費用則是向港口管理局或航運公司支付的罰金。若貨物提前或推遲進場，又或是臨時變更路線，需向港口支付相應費用。這些費用會增加運輸成本，進而影響貨物價格。我們能夠規避滯港費和滯箱費這類港口費用，然而，諸如碼頭操作費和貨物手續費等部分港口費用則無法規避。
    影響港口費用的因素眾多，涵蓋貨物類型、包裝方式、貨物重量以及在港口的停留時間等。此外，還有許多外部因素也會對港口費用產生影響。例如，當港口出現擁堵時，卸載集裝箱所需時間更長，集裝箱在港口停留時間越長，最終需向港口支付的集裝箱存儲費就越高，而這并非貨主的過錯。若事先了解各類港口費用，就能更好地規劃運輸流程，避免產生不必要的港口費用。
    貨物手續費：貨物手續費，也稱碼頭費，是針對從船上卸載或裝載入船的所有貨物所收取的費用。
    碼頭操作費：碼頭操作費（THC）是另一項無法規避的集裝箱港口費用。
    港口倉儲費：港口倉儲費是針對集裝箱在碼頭場地、倉庫或堆場內占用空間而支付的費用，倉儲期限從集裝箱入庫起至離庫結束。
    提前到達費：多數港口都有嚴格的時間表。若集裝箱提前到達港口，需支付提前到達費。
    延遲進場費：延遲進場費與提前到達費類似，若集裝箱比計劃時間晚到，港口會向貨主收取延遲進場費。
    港口裝卸費：這是港口針對集裝箱收取的附加費用，有些港口可能會對集裝箱裝卸收取額外費用。
    刪單或改單費：在任何行業，客戶取消或修改服務都會產生一定費用，尤其是臨時取消或修改。航運業也不例外。
    滯港費：滯港費是承運人對集裝箱在碼頭內超期使用所收取的費用。
    滯箱費：與滯港費不同，滯箱費是針對集裝箱在港口以外超期使用所收取的費用。